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罷官期間酈道元開始著手為《水經》註疏事宜。
孝明帝正光五年起復酈道元，擔任河南尹治理京城洛陽。
主要影響
政治:酈道元終身仕於北魏，為官期間嚴猛以治，不避權貴。
延昌四年，酈道元任東荊州刺史之時遇到宣武帝去世，胡太后臨朝的變故。國勢每況愈下，但他卻不顧時勢艱危和個人得失採用威猛為治的方法。
不因權勢而改變規章制度，使蠻夷服其威名不敢為寇。他同時又建立庠序，樹立向學風氣，意圖從文化上改變魯陽這個落後地區的面貌。
司州牧，汝南王元悅嬖倖小人，丘唸作惡多端，酈道元將丘念入獄。不懼胡太后的權威搶先處決丘念並揭發汝南王的奸惡而加以彈劾可謂剛正勇敢。
軍事:孝昌年間徐州刺史元法僧在彭城反叛，酈道元受朝廷的派遣指揮了這次平叛的軍事行動。軍隊到達渦陽後，叛軍戰敗撤退，酈道元追逐討伐。多有斬殺俘獲。
此外酈道元在《水經注》中記載了歷史上各地發生的大小戰役戰鬥不下三百次。而且對作戰雙方不容忽視的地理條件如山嶽，關隘，河川，渡口，橋樑，倉儲等進行了詳細描述。後人評其“開兵要地理之先河”。
重點記載了各地的重要關隘一百四十多處，為唐以後的《地理志》書所效仿並且明確提出了“關依人而固”的軍事觀點，堪稱精闢。
地理:酈道元寫成地理著作是當時一部空前的地理學巨著，它名義上是註釋實際上是在《水經》基礎上的再創作。此書不僅開創了古代寫實地理學的歷史而且在世界地理學發展史上也佔有重要的地位。
在後世學者對其不斷的研究中逐漸形成了一門學問——酈學。
酈道元作為一位傑出的地理學家在《水經注》的序言中對前代的著名地理著作進行了許多點評，在編纂《水經注》時酈道元引用的歷史文獻和資料多達480種，屬於地理類的就有109種以及酈道元親身考察所得到的資料，還有不少漢，魏時代的碑刻材料，這又是研究中國文明發展歷史的極其寶貴的資料。
文學:酈道元在寫《水經注》時所使用的文字新穎多變，不用陳詞濫調。例如瀑布這個詞彙，他絕不刻板地使用瀑布這個詞彙而是根據瀑布的不同形象以變化無窮的文字來進行描述。
如“洪”“淤”“懸流”“懸水”“懸澗”“懸波”“飛清”“飛泉”等，讓讀者隨時有新鮮生動之感。他也創造了許多維妙維肖的語言進行描寫，又如對於溪泉水流的清澈現象，例如他在卷二十二《清水注》中說:“綠水平潭，清潔澄深，俯視游魚類，若乘空矣，所謂淵無潛鱗也。”
卷三十七《澧水注》中則說:“水色清澈，漏石分沙。”除了自己創作生動的語言以外，酈道元還善於吸取別人的生動語言以豐富他自己的寫作。
當今的不少遊記選編以及語文課本中也常常選入此書中的精彩片段，這些也都說明《水經注》一書在文學上的造詣和價值。
後世影響
酈道元的著作在後世學者對其不斷的研究中逐漸形成了一門學問——酈學。
自從隋唐以來不少學者就已對進行研究，但酈學作為一門學問要到明朝以後才獲得發展。
清乾隆時期由於先後出現了全祖望，趙一清，戴震三位酈學大師，酈學研究趨於極盛。
酈學研究先後出現了三個主要流派，首先是考據一流即關注文字本身的修補整理工作。
由於文字生動優美，長期來為士人所喜愛，因此明朝人鍾惺，譚元春評點又發展出詞章學派。
酈學研究中最後形成的是地理學派，因為記敘河流兼及自然地理，因此，到了清末以至民國，又有楊守敬，熊會貞