接下來說，軒轅成為了天子，內部採用刀鋸等刑罰來治理國家，外部則使用兵力來征服其他部落。他還制定了陣法，設定了旌旗和麾牌。如果天下有人不順從他的統治，他就率領軍隊前去征討。當時草木非常茂盛，那些茂密的地方，人們都不敢行走。黃帝命令眾人披荊斬棘，開闢出一條道路來。這片土地的東邊延伸到海邊，西邊到達崆峒山，南邊毗鄰江水，北邊緊鄰著重鬻山。集合了所有諸侯的符契圭瑞，前往釜山朝見。最初的都城設在涿鹿，必須圍繞著軍隊和士兵，建立營地以保衛城池。
當時有慶雲吉祥的象徵，於是就用雲來命名官職。春季的官員稱為“青雲”，夏季的官員稱為“縉雲”，秋季的官員稱為“白雲”，冬季的官員稱為“黑雲”，而中央的官員則稱為“黃雲”。還有黃龍和土螾出現，螾是土壤中的精靈，形體巨大，大約有五六圍，身長十多丈。黃帝說：“這是土德顯現的祥瑞，只有六合（天地、四時、陰陽）相互協調，才能使天下安定，神明就會降臨。”有一天，他夢見兩條龍傳授給他一幅圖，於是他便馬上戒備起來，親自前往河邊，結果天降大雨。過了七天，黃龍揹著圖從河中出現了。黃帝下令讓臣子把圖寫下來，以示天下。來到翠溈的泉水邊，突然有一條大鯉魚逆流而上，它背上揹著一張河圖，向皇帝游來。黃帝跪下接受這張圖。圖案上有著蘭色的葉子和紅色的花紋，五彩繽紛，最後呈現出一張白色的圖案，交給了黃帝。黃帝得到了這五個要點，於是就設立了靈臺，並設立了五個官職，來管理這五個要點的事務。有一本名為“星官之書”的書籍，黃帝命令星官大撓根據斗柄初昏時所指的月建來進行占卜，最終確定了甲子年的開始。用“甲、乙、丙、丁、戊、己、庚、辛、壬、癸”來表示天干，用“子、醜、寅、卯、辰、巳、午、未、申、酉、戌、亥”來表示地支。一個地支配合一個天干，稱為“日”，再以“納晉”確定地支所配的天干。黃帝還命令臣子容成製作出渾天儀，來模擬天空的形狀，綜合六種術數來確定天氣的執行狀態。叟蓲回答說：“天有六種節氣，地有五種制度。使用天時，需要經過六個時期才能準備完畢。終了地紀，需要五年才能完成一週。將六和五相加，得到一年有 三十個月。七百二十個節氣為一紀，六十年有一千四百四十個節氣，才能完成一週。太過或不及，都能從這裡看出來。”根據五種標準來衡量五種氣息，調整它們的消長，觀察它們的發生與收斂。以此來制定曆法。年份以甲寅為紀，日子以甲子為紀，時節已定，就在己酉月的朔旦日子南至的時候，獲得了神的祝福，得到了寶鼎。冕侯問鬼叟蓲說：“這就叫作得了天子的歷數，終而復始。”他們迎接日月朔望的未來，用策推算，創造出十六神歷，積累餘分來安排閏月。每三年需要安排一個閏月，每五年再安排一個閏月，而在十九年中有七年需要安排七個閏月。同時，以甲子年為起點，設定了節氣來管理閏月的位置，從而使曆法與時節相符合。
黃帝命令隸首負責制定“九草演算法”，用來處理數學問題。同時，命令伶倫負責制定“律呂”，用來規範音樂演奏。在大夏的西邊，阮鄃的北面，位於嶰貉山谷中，挑選生長得空竅厚鈞的竹子，將它們砍下來，在兩節之間截斷，製成長三寸九分的黃鐘，作為樂器的音高標準。又製作了十二個筩，用來聽取鳳凰的鳴叫聲，並區別出十二個音律。雄性鳳凰鳴叫六個音，雌性鳳凰也鳴叫六個音。用它們來比擬黃鐘的音高，就產生了六律和六呂。依據氣候的感應，確立了宮、商、角、徵、羽這五種音階，調整陰陽之氣。根據四季變化規律，推算出律歷的計算方法，確定陰陽訊息的變化，調整閏月餘數。黃帝命令臣子榮猿鍾製作了十二個鍾，包括黃鐘、大簇等，用來作為十二個音律的基礎。每當月份的氣節到來時，就設立蔽節，用飛灰來應對氣節的變化。還命令臣子大容創