西夾擊自己，圍攻永福，自己也難逃覆滅的下場。
於是，李子通己打定主意，急令全軍向高郵進發。他想如法炮製，將杜伏威高郵的部隊也給吞併了。而後長期盤踞高郵，這高郵東扼邗溝，北臨淮河，境內溝壑縱橫，蘆葦叢生，正是用兵之所在。
就在李子通抵達高郵之時，杜伏威派往高郵的快馬也將信箋送到高郵守將手中。李子通的計策自然是沒有得逞，雙方隨即爆發戰鬥。這一仗持續了整整十五天，雙方大小接戰十餘場，最終李子通部堅持不住，三萬臨時拼湊起來的大軍逐漸潰散，李子通只好率著本部兵馬向淮河以北敗逃。高郵的杜伏威部守軍雖勝，亦有很大傷亡。
恰恰在這個時候，楊廣令江都的隋軍對高郵發起猛烈進攻。槳帆戰艦順著邗溝駛入高郵境內各個湖泊，隋軍精銳，兩萬驍果軍戰兵步卒傾巢出動向高郵各縣發起全面進攻，除此還有五萬駐守江都的其餘隋軍配合。楊廣甚至出動了天興軍的山地長槍兵和長弓手。
已經損耗嚴重的杜伏威部高郵守軍哪能抵抗的瞭如此猛烈進攻。抵抗了數天後就全線潰敗。三萬賊軍大部分被殲滅，少部分逃向六合。此時，陳俊又加強了六合縣北面的盱胎縣兵力，形成對六合的合圍之勢。
六合縣城的府衙庭院內，杜伏威看著陰霾的天空，眉頭緊鎖的發著呆。如今他的實力大損，所有兵力加起來不到萬人，而且先後損失多名大將，李子通叛變，這些給他的打擊不小。
以前，他不是沒遇到過這種情況，最終還是克服難關，挺過來了，不僅沒滅亡，反而茁壯成長起來。但今時不比往日了，這隋軍顯然實力士氣都大大高於此前，最重要的是民心似乎倒向了隋朝那邊，自己募兵都困難了許多。他知道這是罪己詔的效果，皇帝以詔書的形式表明了悔過的態度，保證不再隨意耗費民力，並且許諾之前徵役民力過度的地區免稅三年。