在巴黎的加尼葉歌劇院，那是一座華麗無比卻又藏著無數秘密的藝術殿堂。它的每一寸牆壁都彷彿在訴說著過去的輝煌與神秘。
年輕的女高音克莉絲汀在歌劇院中嶄露頭角。她擁有天籟般的嗓音，宛如天使降臨人間。然而，她不知道的是，自己已經被歌劇院中的幽靈所注視。
這個幽靈是一個面容醜陋、身形扭曲的人，他一直藏身於歌劇院地下錯綜複雜的迷宮中。他孤獨地在黑暗中生活，歌劇院是他的王國，他在這裡聆聽著每一場演出，每一個音符都能觸動他那敏感而又孤獨的靈魂。
克莉絲汀在一次排練後，獨自留在了歌劇院的舞臺上。當她正準備離開時，突然聽到了一陣空靈的歌聲。那歌聲彷彿有著魔力，引領著她在歌劇院的走廊中穿梭。她不知不覺地來到了一面鏡子前，鏡子竟像一扇門一樣緩緩開啟，克莉絲汀被一股無形的力量拉了進去。
穿過黑暗的通道，她來到了一個地下的湖邊。湖中心有一艘小船，船上點著蠟燭，那個幽靈就坐在船頭。幽靈看著克莉絲汀，他的眼中既有溫柔又有瘋狂。他告訴克莉絲汀，他是她的音樂天使，是他一直在暗中指導她唱歌，賦予了她更美妙的歌喉。
克莉絲汀起初十分害怕，但幽靈那充滿深情的話語和那如夢如幻的歌聲讓她逐漸平靜下來。此後，幽靈時常在這個秘密的地方為克莉絲汀授課，克莉絲汀的演唱水平也日益精進。
然而，隨著克莉絲汀在舞臺上越來越受歡迎，她與貴族勞爾之間產生了愛情。勞爾英俊瀟灑、風度翩翩，他對克莉絲汀展開了熱烈的追求。
幽靈得知後，內心的嫉妒如同火焰般燃燒起來。他開始在歌劇院中製造各種恐怖的事件。演出時，舞臺上的道具會突然失控，差點砸到演員；後臺的更衣室裡會傳來陰森的哭聲，讓工作人員人心惶惶。
有一次，克莉絲汀在表演結束後，回到化妝間，發現鏡子上用血紅色的液體寫著“背叛者”。她驚恐萬分，而此時幽靈的聲音在她耳邊響起，他威脅她要和勞爾斷絕關係，否則將有更可怕的災難降臨。
但克莉絲汀深愛著勞爾，她拒絕了幽靈的要求。幽靈徹底被激怒了，他在歌劇院的一場盛大演出中，讓巨大的吊燈突然墜落。吊燈砸向觀眾席，現場一片混亂，人們尖叫著四處逃竄。
在這場混亂中，幽靈趁機擄走了克莉絲汀，將她帶到了地下迷宮的深處。勞爾心急如焚，他帶著警察在迷宮般的歌劇院地下尋找克莉絲汀。
幽靈把克莉絲汀帶到了他的巢穴，那裡擺放著各種奇怪的物品，有華麗的服飾，也有恐怖的面具。幽靈向克莉絲汀傾訴著自己的痛苦，他從小因為醜陋的面容被人唾棄，歌劇院是他唯一的避難所，而克莉絲汀是他黑暗生命中的唯一光亮，他不能失去她。
就在幽靈準備強迫克莉絲汀永遠和他在一起時，勞爾找到了這裡。幽靈和勞爾展開了一場激烈的搏鬥，幽靈身形詭異，力大無窮，但勞爾為了心愛的克莉絲汀毫不退縮。
在搏鬥中，克莉絲汀看著幽靈那痛苦又瘋狂的眼神，心中湧起一絲憐憫。她勸說幽靈放下仇恨，放過他們。幽靈在克莉絲汀的話語中逐漸冷靜下來，他意識到自己的愛已經變得扭曲。
最後，幽靈放走了克莉絲汀和勞爾，自己消失在了歌劇院的黑暗深處。而歌劇院在經歷了這場可怕的事件後，雖然重新修繕，但那幽靈的傳說卻永遠地流傳了下來，每當有新人來到這裡，都能感受到那一絲若有若無的陰森氣息，彷彿幽靈依舊在某個角落注視著這座他心愛的歌劇院。