官軍和其他反王打的走投無路才來淮南投靠了杜伏威，但他卻一直拒絕杜伏威將他的部屬改編，一直堅持保持著相對的獨立性。
杜伏威當時在淮南也是剛剛立足，強敵四環，也急需聯合他方力量抗敵。所以他只能顧全大局，做出妥協。並且在攻下六合，歷陽，高郵三郡後讓李子通駐守六合，並統管所有六合兵馬。
李子通回到府邸後，一頭倒在床上，卻翻來覆去怎麼也睡不著了。心裡不斷冒出一個又一個念頭，末了他又騰的一下從床上半坐起來，嘴裡自言自語唸叨著：“王侯將相，寧有種乎…老子憑什麼就要一直寄人籬下。老子寧為雞頭不為鳳尾，更何況他算什麼鳳凰。一天一夜就被萬把人的隋軍奪走了歷陽，損兵折將幾萬人。不如老子…”
……
第二天陽光灑滿六合城之時，杜伏威已經起床洗漱完畢，端坐在房內思考下一步該怎麼做，又擔憂起身陷厲城的家眷現在如何了。此時，一個親兵進屋稟報道：“啟稟將軍，李子通將軍派人給將軍送來一盒膳食物。”
杜伏威看了他手中的食盒，點了點頭說：“你就放這吧。”親兵放下食盒轉身走出屋外。杜伏威本無早膳習慣，加上又惦念家人，並無心用膳。過了大半個時辰，他才從食盒中拿出一塊點心。
正要入口時，突然院外殺聲四起。府邸大院內的上募兵卒們不知發生何事，紛紛抄起兵刃向院外湧去。杜伏威也騰的一下站起，早就丟掉了那塊點心，從屋中衝到院中。
在院中，他能隱約聽到“李子通反了，李子通叛變了”的呼叫之聲。杜伏威已然明白怎麼回事，斷喝一聲：“兒郎們，集結軍陣，隨同本將殺出去，誅殺叛賊李子通！”府邸內的六七百上募兵早已訓練有素的在他周圍結好衝鋒陣列，向門外湧出。
院外四周街道上，上募兵卒與李子通叛軍已經殺成一團。更外圍的大街小巷上，全都是黑壓壓的兵士。將整個杜伏威所居的府邸圍的水洩不通。