征服者的艦隊抵達赤道幾內亞時，航行的歷史跨越了幾百年。這片位於非洲西海岸的小島群和大陸沿岸的地區，在明朝時期雖然與中國的聯絡並不頻繁，但卻與葡萄牙、荷蘭等歐洲國家有著密切的海上貿易往來。赤道幾內亞的歷史也因此顯得錯綜複雜，充滿了各種文化的交織和不斷變化的政治形勢。
赤道幾內亞的歷史可以追溯到遠古時期，當地的原住民主要是巴班吉人、福爾人和比奧科島上的基科人等。這些部落在大多數時間裡保持著與外界的隔離，靠狩獵、捕魚和種植為生。赤道幾內亞的比奧科島和大陸部分的吉尼亞海岸，憑藉其天然的港口和豐富的資源，一直是當地人賴以生存的重要依託。特別是比奧科島，它以豐富的漁業資源和可耕作的土地，成為了幾內亞灣地區的一個重要地方。
然而，隨著15世紀末葡萄牙的航海探險深入非洲沿海，赤道幾內亞的歷史發生了變化。葡萄牙人在這裡建立了貿易站，開始與當地居民進行交流和貿易。葡萄牙的航海技術和歐洲的商品逐漸進入赤道幾內亞，而當地人則以黃金、象牙和奴隸作為交換。這一時期，葡萄牙人在這一地區的影響力逐漸擴大，儘管他們並未完全佔領島嶼和海岸線，但他們的商貿和外交活動為赤道幾內亞的歷史帶來了深遠的影響。
16世紀初，隨著葡萄牙的勢力在赤道幾內亞的鞏固，該地區成為了歐洲大國之間爭奪的焦點。尤其是在葡萄牙與西班牙達成分治協議之後，赤道幾內亞便成為了西屬殖民地的一部分。葡萄牙人利用其在非洲海岸的軍事和商業優勢，在比奧科島建立了一個貿易中心，他們在島上修建了港口、倉庫和軍事防禦工事。這些防禦工事以保護葡萄牙的商船免受海盜襲擊，並確保從非洲內陸的貨物能順利運輸到歐洲。葡萄牙的這些舉措雖然為島嶼帶來了商業繁榮，但也在一定程度上加劇了與當地部落的衝突。
17世紀中期，荷蘭的海上貿易帝國逐漸崛起，隨著荷蘭商船的進入，葡萄牙在赤道幾內亞的統治面臨了前所未有的挑戰。荷蘭人不僅在海上與葡萄牙競爭，而且還利用強大的海軍力量，不斷攻擊葡萄牙在幾內亞灣的貿易站和港口。這一時期，赤道幾內亞的比奧科島成為了荷蘭與葡萄牙爭霸的核心區域。荷蘭海軍的不斷挑戰讓葡萄牙不得不加大軍事防禦，儘管如此，荷蘭人仍然逐漸擴充套件了在該地區的影響力。
在明朝時期，儘管中國與赤道幾內亞的直接聯絡較為有限，但中國的航海家和商人早已在印度洋及非洲東岸留下了足跡。尤其是鄭和七下西洋的航程，使得中國的海上文化、技術和商品開始傳播到更遠的地方。鄭和的船隊曾到達東非的部分沿海城市，雖然未深入赤道幾內亞，但鄭和的航海活動為之後中國與非洲的聯絡奠定了某種間接的基礎。中國的瓷器、絲綢和茶葉，經過阿拉伯商人的手流傳到非洲大陸，也為當地商貿活動增添了新的元素。
儘管在明朝的外交和貿易往來中，赤道幾內亞並不是一個主要的焦點地區，但赤道幾內亞作為一個重要的海上節點，仍然在葡萄牙、荷蘭等國家的殖民擴張中發揮了作用。而與此同時，赤道幾內亞的原住民與歐洲殖民者之間的關係也日益緊張。葡萄牙透過貿易和外交手段控制了比奧科島，並透過奴隸貿易、象牙貿易等手段牟取暴利。與此同時，島嶼上的原住民在強烈的歐洲殖民壓力下，逐漸接受了西方的文化和宗教影響。
進入18世紀後，葡萄牙與荷蘭的競爭逐漸減弱，但西班牙逐步取代葡萄牙，成為赤道幾內亞的主要殖民力量。西班牙與葡萄牙的交替，使得赤道幾內亞成為了一個典型的殖民地衝突和政治鬥爭的場所。西班牙人加強了對該地區的殖民統治，他們的經濟活動以農業和資源開採為主，島嶼和沿海地區成為了西方殖民者的殖民基地和商業據點。
直到19世紀，隨著歐