由於妲己對申公豹的戒備，導致費仲和尤渾這兩個狗腿子在提防申公豹同時，還處處針對，申公豹是來享受人間富貴和完成張安之交給他的封神使命，不是來勾心鬥角的，在他用秘法得知了費仲和尤渾其實都是妲己的人之後，就乾脆神魂離體，來見妲己，想要把話說清楚，結果讓申公豹沒有想到的是，原本他以為妲己只是一個普通的人族女子，想不到竟然是妖族同類，而且還是最特別的九尾狐一族。
見兩人都是妖族，申公豹也就沒有拐彎抹角，直接表明了自己的來意，妲己也直接問出了自己想知道的事，申公豹到底是不是來保大商的，申公豹哈哈大笑，說大商存亡其實與他無關，他的任務是完成人祖交代的事情和享福，並且在妲己面前立下誓言，這才讓妲己放心，在那之後，兩人便不再對立，一個繼續在大商裡搞事，一個則是一邊享福，一邊等西岐起兵造反。
此後，妲己與申公豹達成了同盟，他們不僅聯手矇蔽帝辛把持朝政，還針對比干和商容，進行了打壓，導致商容不得不辭官歸隱，比干心灰意冷，不再參與國事，除此之外，他們還設計將姜皇后害死，在帝辛面前汙衊姜皇后扎小人用巫術詛咒帝辛，帝辛大怒，當場就命人剜去姜皇后一目，還炮烙了其雙手，最後姜皇后屈死於後宮之中，這也導致了帝辛兩個孩子，殷郊和殷洪與帝辛決裂，一同叛逃出大商，此事發生後，東伯侯雖然極其憤怒，但是卻沒有表態什麼，只是請求帝辛將姜皇后的屍體給他去安葬，帝辛同意後，東伯侯命人接回屍體厚葬就再無任何訊息。
隨著時間推移到帝辛登基第二十五年，太師聞仲終於率領商軍打敗南疆軍隊，此戰雖然商軍損失慘重，但是南疆軍隊主力盡數被殲滅，叛軍首領被抓，其子與兄弟皆戰死於兩軍交戰中，南疆勢力在此戰之後分裂成了無數個小部族各自為政，自此，歷時十五年的時間，南疆叛亂算是平定了，重歸大商管轄，所有南疆部族奉大商為主，稱臣納貢。
平亂結束後，太師聞仲和鄂侯率領大軍，押解叛軍首領返回大商王朝的都城，原本凱旋而歸的眾人以為百姓們會紛紛夾道歡迎，結果所過之處，皆一片蕭條，太師聞仲見狀十分擔憂，他在前線就收到好幾次都城的傳信，寫的都是帝辛現在不理朝政，國師申公豹和費仲尤渾之輩只知貪圖享樂，不管民間疾苦，之前聞仲心中已有準備，可當他親眼所見，依舊還是被震驚到了，這還是那個他記憶中繁榮無比的大商王朝嗎？
太師聞仲不敢耽擱，將大軍和俘虜全部交給了鄂侯，讓其繼續帶軍回朝，自己則坐著一頭酷似墨麒麟的神獸，立刻趕回到了大商都城。
見太師歸來，帝辛罕見的上朝，本想嘉獎一番聞仲，結果帝辛還未開口，就被聞仲連續的質問給問懵了，太師聞仲指著帝辛，就差破口大罵了，帝辛自己心中有愧也不敢發作，只能推脫身體抱恙，無法處理朝政就灰溜溜的跑了，滿朝文武見太師回來，都好像找到了主心骨一樣，大倒苦水，將這十五年來朝內發生的事情一一跟聞仲抱怨哭訴，聞仲是氣的三尸神暴跳，當下拿出雌雄蛟龍金鞭，雙鞭直接打向費仲和尤渾，申公豹見狀，連忙用開天珠為二人擋下攻擊，費仲和尤渾嚇得屁滾尿流，立刻就跑去尋妲己庇護。
聞仲本來還想連申公豹一起收拾，結果被比干和商容攔下，說明了其身上有人祖令牌後，聞仲才罷手，只是瞪了一眼申公豹，便追出去要打死費仲和尤渾，雙方一個跑一個追，眼看就要插翅難飛，帝辛及時出現阻止了太師聞仲，聞仲失望之餘，無奈的看了看這個完全大變樣的帝辛，最後長嘆了一口氣後，才收起武器離開。
在太師聞仲迴歸之後，大商王朝的氣運有所回升，帝辛又開始打理政務，很多不合理的政令被廢除，那些消耗國力又無用的工程被叫停，眾多魚肉百姓的官員被查處，無數冤假錯案被平