軍隊阻攔。農民軍被迫又逃回桐城，將桐城周圍劫掠，史可法與潘可大率軍圍剿，農民軍敗走廬江。
史可法與左良玉又在楓香驛將農民軍擊敗，三月潘可大與副將程龍在攻打宿松時陣亡，農民軍分出同黨搖天動，另外編為一營合計八營，共二十多萬士兵分別駐紮在桐城的練潭，石井，淘衝等地。總兵官牟文綬，劉良佐率軍在掛車河將其擊敗。
崇禎十一年夏，史可法因為長時間沒有平定農民軍而獲罪，朝廷令他戴罪立功。
崇禎十二年，史可法因為岳父的去世而離職。喪滿後史可法被用為戶部右侍郎兼右僉都御史，接替朱大典總管漕運，巡撫鳳陽，淮安，揚州等地。
史可法彈劾罷免了三個督糧道，增設漕儲道一人。大力疏通南河，使漕務大有整治。
之後調任南京兵部尚書，參贊機密政務。由於軍隊久不訓練，沒有戰鬥力，史可法上奏八條改革意見。
崇禎十七年，史可法聽聞李自成進攻北京，率軍進京勤王。軍隊抵達達浦口時傳來北京失陷，崇禎帝朱由檢自縊的訊息。史可法向北失聲痛哭，以頭撞柱，血流到腳上。史可法為朱由檢發喪，收到了張慎言，呂大器，姜曰廣等人的文書:
“福王朱由崧是神宗的孫子，按輩分排行應當立為君。但是他有七大缺點:貪，酗酒，不孝，虐待下屬，干預官吏。潞王朱常淓是神宗的侄兒，賢良而且聰明。應當立他為君。”史可法也認為如此。
但鳳陽總督馬士英暗地與阮大鋮商議，主張立福王朱由崧並致書史可法稱:論倫理，論次序都應當擁立福王。史可法告訴他們朱由崧的七個缺點，但馬士英聯合了操江提督誠意伯劉孔昭，鎮將劉澤清，劉良佐，高傑，黃得功等人發兵護送朱由崧到儀真，史可法只得迎接。
在歷史上黃德功也是抗清人物之一，而高傑此人被叛將許定國所殺，導致清軍順利南下。
整個南明王朝龜縮南方，縱然有李定國那樣的英雄豪傑也因內部出現叛徒而使北伐失敗，南明也因吳三桂，尚可喜，耿精忠三大漢奸叛將的所做所為加上南明內部爭鬥而亡。
滿清入關併成功篡奪漢人江山純屬意外，如果不是大明腐敗，崇禎個人問題，天災則是小冰河時期和以東林黨，浙黨，楚黨等互相爭鬥又如何讓清朝皇帝坐穩江山？
明朝有忠烈人士，民族英雄，同樣也有漢奸賣國賊，如八大晉商。私自為建奴提供武器，糧食，錢財，卻不向大明交納錢糧，滿清入關建立清朝，八大晉商變成了清朝八大皇商，何其可笑，可嘆！可悲也。
《史可法：動盪時局中的艱難抉擇與堅守》
明朝末年，天下大亂，闖王李自成攻入北京，崇禎帝自縊，明朝滅亡。隨後，清兵入關，中原地區陷入了混亂。在這歷史的關鍵時刻，史可法面臨著一個艱難的抉擇：是否擁立福王朱由崧為帝。
史可法起初並不贊成擁立福王，他有自己的理由。首先，福王朱由崧的品德和能力並不能讓人信服。朱由崧在歷史上並沒有展現出卓越的領導才能，其性格和行為也存在一些問題。其次，當時的局勢十分複雜，各地的勢力紛紛崛起，野心家們趁機上下其手，借擁立之機爭功奪利。南明的局勢已經勢如累卵，如果不能選出一位合適的皇帝，局勢很可能會土崩瓦解，一發不可收拾。然而，儘管史可法深知福王不可立，但他卻面臨著巨大的壓力。四鎮總兵勢力強大，他們執意擁立福王，史可法在武力上無法與之抗衡。此外，朝廷中的一些官員也為了自身利益，紛紛附和四鎮的意見。在這種情況下，史可法為了顧全大局，延續大明皇統，最終被迫同意了四鎮擁立的福王登基稱帝。
史可法的這一決定，在當時引起了不少爭議。一些人認為他背叛了自己的初衷，放棄了自己的原則。然而，從歷史